齐齐哈尔医学院药物计算设计软件购置项目需求公告

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总投资		建设年限
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审批机关		审批事项
审批代码		批准文号
审批时间		审批结果
建设内容

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序号	商品分类	产品名称	参考品牌	参考型号	计量单位	采购数量	产地要求	现货要求	原装正品要求	技术指标
1	行业应用软件	药物计算设计软件	Hermite	V2024	套	1	中国	是	是	1 运行模式：云端布置，浏览器登录即时在线使用；支持多账号同时运行（30个账号以上），平稳运行不卡顿。 2 数据安全：（1）信息系统安全三级备案证明；（2）具有操作权限管理和登记功能：对每个账户管理员能够执行操作登记与权限限制；（3）具有存储按次加密、科研数据保密功能与协议。 3 购买合同形式：一次性支付5年总费用不高于35万元。无其它培训、软件升级、技术指导等任何费用。 4 运行算力：（1）一次性采购费用中，内含不低于10万元算力；（2）能够根据客户实际运行情况，根据客户需求弹性调度算力。 5 技术支持：通过微信、电话、邮件等方式提交技术支持请求，供应商需提供5*8小时电话技术支持；如遇故障，供应商在8小时以内对用户的要求予以回应，48小时内派专业技术人员解决问题。 6 技术培训：软件交付后，组织线上线下全覆盖的使用技能培训，培训内容包括基本原理、操作使用、维护等方面。 1 3D界面交互：平台支持多样的分子展示、选择和编辑功能，在使用计算功能和分析结果时，需要满足实时联动查看蛋白和小分子结构，便于用户基于整体结构进行决策和分享。 2 蛋白质结构预测：能够满足基于深度学习的蛋白质结构预测功能，从蛋白一级序列出发预测蛋白质的3D结构，提供结果的一键展示及置信度评估。 3 分子对接功能：实现快速大批量筛选，支持内置虚拟化合物库，快速完成大化学空间的虚拟筛选任务；支持不同精度的对接方法及打分函数；支持多种限制性对接方法。 4 蛋白质-小分子的结合稳定性分析：支持基于分子动力学模拟的方法衡量小分子-蛋白复合物中小分子结合构象的稳定性；支持不同方式的动力学模拟方法，包括传统分子动力学方法和增强采样方法；可实现动力学轨迹的可视化分析和结果的统计分析。 5 基于MM GB/PBSA的结合自由能计算：支持一键进行分子和蛋白的可视化与编辑、初始结构准备、FEP微扰图和原子映射的构建、计算的监控与结果分析；支持R基团优化、骨架跃迁和大环成环微扰；支持自动生成及手动修改微扰图和原子映射；可实现续算并合并分析结果等。 6 基于自由能微扰的结合自由能计算和分析：支持一键进行分子和蛋白的可视化与编辑、初始结构准备、FEP微扰图和原子映射的构建、计算的监控与结果分析；支持R基团优化、骨架跃迁和大环成环微扰；支持自动生成及手动修改微扰图和原子映射；可实现续算并合并分析结果等。 7 基于自由能微扰计算的蛋白稳定性计算：满足多氨基酸的突变计算，具备结果的可视化分析，可实现计算值与实验值的综合比对分析。 8 水分子自由能计算：满足通过分子动力学模拟，计算得到蛋白中每个水分子的结合自由能及位置，以确定对结合影响较大的关键水分子，指导分子的设计和优化。 9 蛋白翻译后修饰位点预测：利用预训练模型，精确识别和预测蛋白质序列中可能发生翻译后修饰的位点；可实现不同PTM的可视化标注。 10 蛋白-蛋白对接：支持基于快速傅里叶转化相关性技术，计算分子间的相互作用能量和最佳对接位点；支持不同打分函数进行综合评价；支持自定义结合位点。 11 基于AI的蛋白突变稳定性预测：支持基于AI，识别蛋白质序列中的关键特征，并预测特定突变对蛋白质折叠稳定性的影响；支持批量自定义氨基酸突变位点；支持实验值与计算值的综合对比分析。 12 分子生成：可实现基于蛋白口袋的分子生成，提供多种生成方式如片段生长、从头生成；提供分子评价标准及多种结果。 13 自动化定量构效关系分析：只需输入SMILLS及其对应的属性，即可自动构建不同类型的模型，且具备自动化参数优化的功能；结合多维的分子表征方式，可提高性质预测的准确性。 14 小分子结构处理与分析：包含分子建模、能量最小化、构象搜索和分子性质计算等算法，能够对小分子进行精确结构优化和性质预测；支持结构预处理、分子相似性搜索等。 15 基于冷冻电子显微镜的结构优化功能：具备基于冷冻电子显微镜密度图的全原子结构模型柔性搭建功能，结合分子动力学模拟和深度学习算法，方便快速获得与密度图相吻合的高质量的分子结构模型。 16 能基于动力学的方法，对蛋白柔性环区结构优化，实现不同算法模型的综合评估，获得更合理的蛋白环区构象。 17 虚拟筛选工作流：整合多精度方法的虚拟筛选工作流，可实现从低精度到高精度多种计算方法；支持不同精度方法工作流式筛选 18 蛋白质结构处理与分析：能够为复杂的蛋白质结构数据提供更为全面完善的结构预处理，支持蛋白loop区域优化、蛋白质结构叠合等。

序号

商品分类

产品名称

参考品牌

参考型号

计量单位

采购数量

产地要求

现货要求

原装正品要求

技术指标

行业应用软件

药物计算设计软件

Hermite

V2024

套

中国

是

1 运行模式：云端布置，浏览器登录即时在线使用；支持多账号同时运行（30个账号以上），平稳运行不卡顿。
2 数据安全：（1）信息系统安全三级备案证明；（2）具有操作权限管理和登记功能：对每个账户管理员能够执行操作登记与权限限制；（3）具有存储按次加密、科研数据保密功能与协议。
3 购买合同形式：一次性支付5年总费用不高于35万元。
无其它培训、软件升级、技术指导等任何费用。
4 运行算力：（1）一次性采购费用中，内含不低于10万元算力；（2）能够根据客户实际运行情况，根据客户需求弹性调度算力。
5 技术支持：通过微信、电话、邮件等方式提交技术支持请求，供应商需提供5*8小时电话技术支持；如遇故障，供应商在8小时以内对用户的要求予以回应，48小时内派专业技术人员解决问题。
6 技术培训：软件交付后，组织线上线下全覆盖的使用技能培训，培训内容包括基本原理、操作使用、维护等方面。
1 3D界面交互：平台支持多样的分子展示、选择和编辑功能，在使用计算功能和分析结果时，需要满足实时联动查看蛋白和小分子结构，便于用户基于整体结构进行决策和分享。
2 蛋白质结构预测：能够满足基于深度学习的蛋白质结构预测功能，从蛋白一级序列出发预测蛋白质的3D结构，提供结果的一键展示及置信度评估。
3 分子对接功能：实现快速大批量筛选，支持内置虚拟化合物库，快速完成大化学空间的虚拟筛选任务；支持不同精度的对接方法及打分函数；支持多种限制性对接方法。
4 蛋白质-小分子的结合稳定性分析：支持基于分子动力学模拟的方法衡量小分子-蛋白复合物中小分子结合构象的稳定性；支持不同方式的动力学模拟方法，包括传统分子动力学方法和增强采样方法；可实现动力学轨迹的可视化分析和结果的统计分析。
5 基于MM GB/PBSA的结合自由能计算：支持一键进行分子和蛋白的可视化与编辑、初始结构准备、FEP微扰图和原子映射的构建、计算的监控与结果分析；支持R基团优化、骨架跃迁和大环成环微扰；支持自动生成及手动修改微扰图和原子映射；可实现续算并合并分析结果等。
6 基于自由能微扰的结合自由能计算和分析：支持一键进行分子和蛋白的可视化与编辑、初始结构准备、FEP微扰图和原子映射的构建、计算的监控与结果分析；支持R基团优化、骨架跃迁和大环成环微扰；支持自动生成及手动修改微扰图和原子映射；可实现续算并合并分析结果等。
7 基于自由能微扰计算的蛋白稳定性计算：满足多氨基酸的突变计算，具备结果的可视化分析，可实现计算值与实验值的综合比对分析。
8 水分子自由能计算：满足通过分子动力学模拟，计算得到蛋白中每个水分子的结合自由能及位置，以确定对结合影响较大的关键水分子，指导分子的设计和优化。
9 蛋白翻译后修饰位点预测：利用预训练模型，精确识别和预测蛋白质序列中可能发生翻译后修饰的位点；可实现不同PTM的可视化标注。
10 蛋白-蛋白对接：支持基于快速傅里叶转化相关性技术，计算分子间的相互作用能量和最佳对接位点；支持不同打分函数进行综合评价；支持自定义结合位点。
11 基于AI的蛋白突变稳定性预测：支持基于AI，识别蛋白质序列中的关键特征，并预测特定突变对蛋白质折叠稳定性的影响；支持批量自定义氨基酸突变位点；支持实验值与计算值的综合对比分析。
12 分子生成：可实现基于蛋白口袋的分子生成，提供多种生成方式如片段生长、从头生成；提供分子评价标准及多种结果。
13 自动化定量构效关系分析：只需输入SMILLS及其对应的属性，即可自动构建不同类型的模型，且具备自动化参数优化的功能；结合多维的分子表征方式，可提高性质预测的准确性。
14 小分子结构处理与分析：包含分子建模、能量最小化、构象搜索和分子性质计算等算法，能够对小分子进行精确结构优化和性质预测；支持结构预处理、分子相似性搜索等。
15 基于冷冻电子显微镜的结构优化功能：具备基于冷冻电子显微镜密度图的全原子结构模型柔性搭建功能，结合分子动力学模拟和深度学习算法，方便快速获得与密度图相吻合的高质量的分子结构模型。
16 能基于动力学的方法，对蛋白柔性环区结构优化，实现不同算法模型的综合评估，获得更合理的蛋白环区构象。
17 虚拟筛选工作流：整合多精度方法的虚拟筛选工作流，可实现从低精度到高精度多种计算方法；支持不同精度方法工作流式筛选
18 蛋白质结构处理与分析：能够为复杂的蛋白质结构数据提供更为全面完善的结构预处理，支持蛋白loop区域优化、蛋白质结构叠合等。

省份	黑龙江	城市	齐齐哈尔市
招标代理机构		项目名称	齐齐哈尔医学院药物计算设计软件购置项目
采购单位	齐齐哈尔医学院立即查看	采购联系人	登录即可免费查看
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